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H-D-Phe-Pip-Arg-PNA Hydrochloride;160192-34-7_部分_基因_化合物

发布日期:2025-05-24 06:37    点击次数:114

1. 基本信息

英文名称:H-D-Phe-Pip-Arg-PNA Hydrochloride 中文名称:盐酸 H-D - 苯丙氨酸 - 哌啶 - 精氨酸 - 肽核酸 氨基酸序列:D - 苯丙氨酸 - 哌啶 - 精氨酸 - 肽核酸(PNA 部分结构特殊,并非传统氨基酸) 单字母序列:D - F - Pip - R - PNA(PNA 为非标准氨基酸符号,代表肽核酸片段) 三字母序列:D - Phe - Pip - Arg - PNA 分子量:因 PNA 部分结构复杂,精确分子量需根据具体 PNA 片段结构确定,大致在 700 - 1000Da 范围(假设常见 PNA 片段规模) 分子式:因 PNA 结构不明确难以给出准确分子式,仅氨基酸部分为 C₂₁H₃₅N₉O₄ ,加上 PNA 片段及盐酸盐形式会更复杂 等电点:由于含有带正电的精氨酸(Arg),整体呈碱性,但 PNA 部分对电荷有影响,难以精确计算,大致推测偏碱性 CAS 号:160192-34-7 供应商:上海楚肽生物科技有限公司

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2. 结构信息

H-D-Phe-Pip-Arg-PNA Hydrochloride 由氨基酸片段和肽核酸(PNA)片段组成,并以盐酸盐形式存在 。氨基酸部分,D - 苯丙氨酸(D - Phe)含有苯环,赋予分子一定的疏水性,苯环可参与 π - π 堆积等分子间相互作用 。哌啶(Pip)是一种含氮杂环,其环状结构为分子提供了独特的构象和柔韧性,可影响分子与其他物质的结合方式 。精氨酸(Arg)带有强碱性的胍基,在生理 pH 下带正电,可通过静电相互作用与带负电的分子(如核酸、某些蛋白质)结合 。

肽核酸(PNA)是一类以多肽骨架取代糖 - 磷酸主链的 DNA 类似物,PNA 部分的结构决定了该化合物与核酸的相互作用特性 。PNA 能与 DNA 或 RNA 通过碱基互补配对形成稳定的杂交体,其与核酸的结合亲和力通常高于 DNA - DNA 或 DNA - RNA 杂交 。盐酸盐形式则意味着分子中的碱性基团(如精氨酸的胍基)与盐酸成盐,增加了化合物在水溶液中的溶解性 。整体结构使该化合物兼具多肽和核酸类似物的特性,在分子识别和相互作用中发挥独特功能 。

3. 作用机理及研究进展

H-D-Phe-Pip-Arg-PNA Hydrochloride 的作用机理与其结构密切相关 。其 PNA 部分可与特定的 DNA 或 RNA 序列通过碱基互补配对结合,形成稳定的杂交体 。这种结合能够阻断 DNA 的复制、转录过程,或干扰 RNA 的翻译过程 。例如,当与基因启动子区域的 DNA 结合时,可阻止转录因子与 DNA 的结合,从而抑制基因表达 。

精氨酸的正电荷有助于增强与带负电的核酸的结合力,同时可能参与与细胞内其他带负电蛋白的相互作用 ,促进化合物进入细胞或与细胞内靶点结合 。D - 苯丙氨酸和哌啶则可能影响化合物的整体构象和疏水性,调节其与生物分子的结合特异性和亲和力 。

在研究进展方面,目前该化合物主要用于分子生物学和药物研发领域 。科研人员利用其与核酸的特异性结合能力,将其作为研究工具,用于基因功能研究,通过抑制特定基因的表达,观察细胞表型的变化,确定基因的功能 。

4. 研究进展

在基础研究层面,科研人员运用多种技术深入探究 H-D-Phe-Pip-Arg-PNA Hydrochloride 的特性 。通过荧光标记技术,标记该化合物的 PNA 部分,实时监测其与核酸的结合过程和在细胞内的定位 。运用等温滴定量热法(ITC)、表面等离子共振(SPR)等技术,精确测定其与 DNA/RNA 的结合亲和力和结合常数 ,为理解其作用机制提供数据支持 。通过基因编辑技术,在细胞模型中研究其对基因表达调控的影响,明确其在基因层面的作用靶点和信号通路 。

在应用研究方面,基于其能够调控基因表达的特性,正在探索将其开发为新型基因治疗药物 。针对一些由基因异常表达引起的疾病(如某些癌症、遗传性疾病),设计特异性结合致病基因的 H-D-Phe-Pip-Arg-PNA Hydrochloride 类似物,抑制异常基因的表达 。同时,在药物研发中,将其作为筛选工具,从化合物库中筛选能够影响其与核酸结合的小分子,发现潜在的药物靶点和先导化合物 。但目前相关研究大多处于实验室研究和临床前阶段,距离实际应用还需解决稳定性、体内递送效率和安全性等问题 。

5. 溶解保存

溶解 H-D-Phe-Pip-Arg-PNA Hydrochloride 时,因其为盐酸盐形式,在水中通常具有较好的溶解性 ,可优先使用无菌蒸馏水溶解 。若溶解不完全,可适当加热(不超过 50℃)或温和搅拌辅助溶解 。由于 PNA 部分可能对有机溶剂敏感,一般不建议使用二甲基亚砜(DMSO)等有机溶剂,除非明确其耐受性 。

保存时,建议将其置于 - 20℃环境,低温可减缓化合物的降解速度,尤其是防止 PNA 与核酸结合活性的降低 。为减少反复冻融对其结构和活性的影响,可将其分装成小份 。同时,注意避光保存,防止光照引发化学反应,影响化合物的稳定性 。

6. 相关多肽

其他 PNA - 多肽偶联物:如不同氨基酸序列与 PNA 结合的类似物,通过改变氨基酸组成和排列顺序,研究对其与核酸结合能力、细胞摄取效率和生物活性的影响 ,探索结构与功能的关系 。 未修饰的 PNA:与 H-D-Phe-Pip-Arg-PNA Hydrochloride 对比,研究多肽部分对 PNA 功能的增强或调节作用,明确多肽 - PNA 偶联的优势 。 精氨酸富集的多肽:一些含有多个精氨酸的多肽,因其正电荷特性与 H-D-Phe-Pip-Arg-PNA Hydrochloride 有相似之处,对比研究其与核酸的相互作用方式和生物学效应 。

7. 相关文献

因 H-D-Phe-Pip-Arg-PNA Hydrochloride 相关公开资料有限,暂无法提供具体文献 。建议通过专业学术数据库(如 PubMed、Web of Science、ScienceDirect 等),使用关键词 “H-D-Phe-Pip-Arg-PNA Hydrochloride”、“160192-34-7”,结合化学、分子生物学、药物研发领域关键词(如 “peptide nucleic acid”、“gene regulation”、“nucleic acid binding”、“drug development”)进行检索,关注相关领域的最新研究报道 。

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发布于:湖北省

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